人工智能加速作物表观遗传设计育种

郭位军, 李东维, 谢上, 杨立文, 李聪, 田健, 普莉, 谷晓峰

Artificial Intelligence Accelerates Epigenetics and Plant Breeding

Weijun GUO, Dongwei LI, Shang XIE, Liwen YANG, Cong LI, Jian TIAN, Li PU, Xiaofeng GU

图2 表观遗传修饰检测方法 BS-seq：亚硫酸氢盐测序；MeDIP-seq： DNA甲基化免疫共沉淀测序；MeRIP-seq： RNA甲基化免疫共沉淀测序；ChIP-seq： 染色质免疫共沉淀测序；SMRT-seq和Nanopore-seq： 三代单分子测序；ATAC-seq：转座酶染色质可及性测序；HiC： 染色质构象捕捉技术

Fig. 2 Technologies relevant to epigenome BS-seq：Bisulfite sequencing； MeDIP-seq： Methylated DNA immunoprecipitation sequencing； MeRIP-seq： Methylated RNA immunoprecipitation sequencing； ChIP-seq： Chromatin immunoprecipitation sequencing； SMRT-seq： Single-molecule real-time sequencing；Nanopore-seq： Nanopore sequencing； ATAC-seq： Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing （HTS）； HiC： High-throughput chromosome conformation capture technology