宏转录组学在微生物生态学研究中的应用

doi:10.3969/j.issn.1008-0864.2011.04.09

›› 2011, Vol. 13 ›› Issue (4): 58-65.DOI: 10.3969/j.issn.1008-0864.2011.04.09

宏转录组学在微生物生态学研究中的应用

李晓晖,李鑫鑫,张维,燕永亮,陈明,陆伟

(中国农业科学院生物技术研究所, 北京 100081)

收稿日期:2011-03-10 修回日期:2011-04-14 出版日期:2011-08-15 发布日期:2011-06-14
通讯作者: 陆伟,副研究员,主要从事微生物基因工程研究。E-mail:luwei0317@vip.sina.com
作者简介:李晓晖,硕士研究生,研究方向为微生物基因资源。E-mail:lixiaohui0325@hotmail.com。
基金资助:
国家973计划项目(2007CB109203);国家转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08003-003B;2009ZX08009-057B;2009ZX08016-002A)资助。

Application of Metatranscriptomics in Microbial Ecology

LI Xiao-hui, LI Xin-xin, ZHANG Wei, YAN Yong-liang, CHEN Ming, LU Wei

(Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China)

Received:2011-03-10 Revised:2011-04-14 Online:2011-08-15 Published:2011-06-14

摘要/Abstract

摘要：

宏转录组学是一门在整体水平上研究某一特定环境、特定时期群体生物全基因组转录情况以及转录调控规律的学科。概述了新兴的宏转录组学在微生物生态学研究中的进展,并总结了其与微生物宏基因组学研究方法相比的优缺点。宏转录组学是一种新颖有效的方法,在微生物生态学,甚至在复杂微生物群落的生态学研究中都具有广阔的应用前景。

关键词: 宏转录组学;原理;特点;微生物生态

Abstract:

Metatranscriptomics is an area to study the gene transcriptional rules of certain organisms in specific environment and time. This paper summarized the progress of metatranscriptomics on microbial ecology, and compared its advantages and disadvantages with meta-genomics. Metatranscriptomics has a promising future as a direct and efficient method to study transcription and gene regulation in microbial ecology and with complex microbial communities.

Key words: metatranscriptomics, principle, characteristic, microbial ecology

中图分类号:

Q789

李晓晖,李鑫鑫,张维,燕永亮,陈明,陆伟. 宏转录组学在微生物生态学研究中的应用[J]. , 2011, 13(4): 58-65.

LI Xiao-hui, LI Xin-xin, ZHANG Wei, YAN Yong-liang, CHEN Ming, LU Wei. Application of Metatranscriptomics in Microbial Ecology[J]. , 2011, 13(4): 58-65.

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Application of Metatranscriptomics in Microbial Ecology

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