水稻OsDDM1a和OsDDM1b基因应答非生物胁迫的表达特性分析

doi:10.3969/j.issn.1008-0864.2011.03.07

›› 2011, Vol. 13 ›› Issue (3): 41-46.DOI: 10.3969/j.issn.1008-0864.2011.03.07

水稻OsDDM1a和OsDDM1b基因应答非生物胁迫的表达特性分析

高振蕊,张海文,黄荣峰

(中国农业科学院生物技术研究所, 北京 100081)

收稿日期:2011-03-28 修回日期:2011-04-24 出版日期:2011-06-15 发布日期:2011-06-15
通讯作者: 黄荣峰,研究员,博士生导师,主要从植物抗逆分子生物学研究。E-mail:rfhuang@caas.net.cn
作者简介:高振蕊,硕士研究生,主要从事植物抗逆分子生物学研究。E-mail:gzr1985@126.com。
基金资助:
国家自然科学基金项目(C0601-30971542)资助。

Expressive Characteristics Analysis of OsDDM1a and OsDDM1b in Response to Abiotic Stresses of Rice

GAO Zhen-rui, ZHANG Hai-wen, HUANG Rong-feng

(Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China)

Received:2011-03-28 Revised:2011-04-24 Online:2011-06-15 Published:2011-06-15

摘要/Abstract

摘要：

环境胁迫会引起植物基因组DNA甲基化水平改变和组蛋白修饰变化,而DNA甲基化与组蛋白修饰在基因表达的调控过程中具有重要作用。分析表明水稻OsDDM1a和OsDDM1b基因属于SWI2/SNF2家族,编码染色质重塑酶,氨基酸序列的相似性达92.82%。OsDDM1a和OsDDM1b的表达均受ABA、NaCl、低温和干旱胁迫诱导,且这两个基因的启动子序列中均含有ABRE、DRE、MYC和WRKY等应答不同胁迫信号的元件。因此,推测水稻在感受外界刺激后可能通过激活OsDDM1a和OsDDM1b的表达,使水稻基因组DNA发生相应的甲基化修饰,进而调控相关基因的表达,表明OsDDM1a和OsDDM1b在水稻胁迫应答反应中发挥重要的作用。

关键词: 干旱胁迫;OsDDM1a;OsDDM1b;DNA甲基化;水稻

Abstract:

Environmental stress can cause changes of DNA methylation and histone modification in plants, which play important roles in regulation of gene expression. OsDDM1a and OsDDM1b, encoding chromatin remodeling enzymes, belong to SWI2/SNF2 family, and their amino acid sequence identity is up to 92.82%. They could be induced by ABA, NaCl, low temperature and drought stress. Several important cis-elements present were found in their promoter sequences, including ABRE、DRE、MYC and WRKY, which play key roles in response to environmental stress. Therefore, rice might change its level of DNA methylation by activating the expression of OsDDM1a and OsDDM1b in response to various environmental stresses, implying these 2 genes have pivotal function in stress tolerance.

Key words: abiotic stress, OsDDM1a, OsDDM1b, DNA methylation, rice

中图分类号:

Q786

高振蕊,张海文,黄荣峰. 水稻OsDDM1a和OsDDM1b基因应答非生物胁迫的表达特性分析[J]. , 2011, 13(3): 41-46.

GAO Zhen-rui, ZHANG Hai-wen, HUANG Rong-feng. Expressive Characteristics Analysis of OsDDM1a and OsDDM1b in Response to Abiotic Stresses of Rice[J]. , 2011, 13(3): 41-46.

[1]	李超,张锐,任茂智,王远,孙国清,孟志刚,周焘,郭三堆*. 二穗短柄草BdTOR基因的克隆及功能分析[J]. , 2015, 17(1): 71-77.
[2]	杨雯涵,郭晓晶,陈轶群,吕俊楠,谢飞,曹云鹤*. 一种酸性木聚糖酶在毕赤酵母中的分泌表达及体外活性评价研究[J]. , 2013, 15(5): 59-66.
[3]	李俊容\|杨凤玺\|刘志斌\|杨毅\|李旭锋*. 拟南芥AtOHRP1在氧化胁迫应答中的功能初探[J]. , 2013, 15(5): 93-99.
[4]	杨虹伟,翟先芝,刘志斌,王健美,李旭锋,杨毅*. 两个高度同源的RING结构域蛋白功能初步研究[J]. , 2013, 15(5): 100-105.
[5]	柳小庆,陈茹梅. 增强外源基因在转基因植物中表达的策略[J]. , 2012, 14(1): 76-84.
[6]	李圣彦1,2,郎志宏2,朱莉2,李秀影1,2,张杰3,何康来3,黄大昉2. 利用密码子优化提高Bt cry1Ah基因在转基因玉米(Zea mays L.)中的表达[J]. , 2011, 13(6): 20-26.
[7]	崔严方,孙佩龙,刘新奇. EIAV gp45和 HIV gp120基因在不同表达系统中表达效果比较[J]. , 2011, 13(4): 72-78.
[8]	文国琴1,2,柴靓1,刘震1,李德款1,罗勤1,李旭锋1,王健美1,杨毅1. 拟南芥电压依赖型阴离子通道参与水杨酸信号应答[J]. , 2011, 13(3): 35-40.
[9]	常敏,乔宇,丁宏标. 谷氨酸棒杆菌麦芽寡糖基海藻糖水解酶基因的克隆与表达[J]. , 2011, 13(3): 47-52.
[10]	董世雷1,2,刘伟2,朱立颖2,王学琴3,于宏伟4,王欣2. 大肠杆菌外膜蛋白酶基因OmpT的克隆及表达[J]. , 2011, 13(2): 53-58.
[11]	王建设1,2,柏映国2,尹俊1,姚斌2. 脂环酸芽孢杆菌Alicyclobacillus sp. A15木聚糖酶基因xynA15的克隆表达及性质研究[J]. , 2010, 12(6): 114-119.
[12]	陈霞,宋波涛,杨建文,谢从华,柳俊. 马铃薯块茎低温反应抑制差减文库的构建及鉴定[J]. , 2010, 12(6): 68-74.
[13]	罗建杰1,王亚茹1,袁铁铮1,柏映国1,黄火清1,罗会颖1,姚斌1,范云六2. 高比活木聚糖酶XYN-W及其突变体在酵母中的高效表达[J]. , 2010, 12(5): 80-85.
[14]	童仕波1,2,文国琴1,林敏2,杨毅1,李旭锋1. 转耐辐射球菌irrE基因提高拟南芥盐胁迫耐受性的表型分析[J]. , 2010, 12(4): 90-94.
[15]	邓载安1,2,3,张治礼1,2,4,张执金3,黄荣峰3. 水稻L-半乳糖途径相关基因的表达特性[J]. , 2010, 12(4): 95-100.

水稻OsDDM1a和OsDDM1b基因应答非生物胁迫的表达特性分析

Expressive Characteristics Analysis of OsDDM1a and OsDDM1b in Response to Abiotic Stresses of Rice

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics